Википедия
Альфа-спираль — типичный элемент вторичной структуры белков , который имеет форму правозакрученой винтовой линии и в котором каждая аминогруппа (-NH) в каркасе образует водородную связь с карбонильной группой (-C=O) аминокислоты , находящейся на 4 аминокислоты раньше (водородная связь i + 4 → i). Этот элемент вторичной структуры иногда также называется классической альфа-спиралью Полинга-Кори-Брэнсона по именам авторов, впервые описавших эту структуру в 1951 году.
Параметры идеальной α-спирали:
- число аминокислотных остатков на виток спирали — 3,6-3,7
- диаметр спирали — 1,5 нм
- шаг спирали — 0,54 нм
- на один аминокислотный остаток приходится 0,15 нм
Такие параметры вычислены исходя из предположения, что конформация всех аминокислотных остатков , входящих в состав α-спирали, одинакова. Однако в реальных белках конформации отдельных аминокислотных остатков немного различаются, что может приводить к небольшому искривлению оси спирали, к разному количеству аминокислотных остатков в витках спирали и т. п.